金魚波妞是魔法師和海之女神的孩子，翹家後在海邊遇到五歲男孩宗介，因為舔了宗介手指上的傷口而化成半魚人。被父親逮到的波妞再度逃走，強大魔力引發颱風巨浪淹沒了宗介居住的村莊，最後波妞得到父母的理解，變成人類女孩來到宗介身邊。

由於片中的巨浪太寫實，日本三一一地震後電視台全面禁播崖上的波妞電影及主題曲避免聯想。台灣同樣籠罩在颱風陰影下，不少產險商品如車體損失險、住宅火險都有颱風及洪水相關的附加條款可以額外投保，為水災風險增添防護。