5~10月為日本腦炎流行季，6~7月更是高峰期，2010至2015年病例分布以中南部為多，今（2015）年6月23~29日新增7個日本腦炎確定病例，分別為台南市5例及雲林縣2例，目前7名患者住院治療中。

日本腦炎是感染日本腦炎病毒引起的急性腦膜腦炎，病毒在豬、牛身上繁殖，再經由蚊子叮咬而傳染，病媒蚊以三斑家蚊為主，喜歡孳生在水稻田、灌溉溝渠、池塘、草地積水、大型容器等處，叮咬高峰時段為黎明和黃昏，大部分患者沒有症狀，或只是出現頭痛、發燒、疲倦等症狀，少數患者有嗜睡、劇烈頭痛、嘔心、意識模糊、抽搐、痙攣、重度昏迷等症狀，嚴重甚至死亡，致死率為2~3成。

控制病媒蚊、減少蚊蟲叮咬、疫苗接種是控制日本腦炎的方法，其中接種疫苗是最有效的預防方法，接受完整疫苗劑量後，10年內疫苗效果仍可超過80％，台灣自1968年起針對幼兒實施疫苗接種後，確定病例數已逐年下降。

疾管署呼籲，過去未曾接種疫苗的民眾，住家或工作場所鄰近豬舍、水稻田等高風險環境，或自覺有感染風險者，可考慮自費接種疫苗；此外，平時應穿著淺色長袖衣褲，並塗抹防蚊藥劑，以防止遭叮咬感染。